Я (автор темы) пока проблему вибрации не решил.
На большие расстояния не езжу, а по городу этой вибрации не чувствуется,
только если специально постараться, замедлить движение педали при переключениях.
Сейчас пробег 15000 км. На 13300 был на ТО-1, попытался пожаловаться на сервисе на вибрацию, но не получилось продемонстрировать дефект.

В тот день ехал в сервис с утра, 180 км, мороз был -23 -25 градусов, сцепление работало мягко. Мастер сел на машину, говорит хорошо у вас всё работает. А оно в этот момент так и было.
Сейчас вот вечером, когда ставлю машину в гараж четко слышу довольно звонкое, тихое цоканье выжимного подшипника. Чуть нажимаешь на педаль сцепления и сразу звук исчезает. Ни на что не влияет, продолжаю наблюдать за этим.
С уровнем масла в коробке у меня нормально, при пробеге 450 км лично слил заводское масло из коробки и залил полностью новое. Да и не должно это влиять на сцепление.