Ничего страшного.
Вы страхуете/пролонгируете полис КАСКО с повреждениями ТС.
В Акте осмотра ТС при страховании будет отметка о наличии повреждений и то, что есть направление на СТО.
После ремонта Вы показываете ТС и составляется новый Акт осмотра - ТС без повреждений.
Новый полис КАСКО /пролонгация старого - не означает, что ТС ремонтироваться после этого не будет.