Всё верно, только если откажешься от замены они пометку сделают в твоей истории "от замены отказался", а это в свою очередь повлечёт отказ в гарантийном ремонте, если такая необходимость возникнет.
Если официалы обнаружили проблему, которая решается в рамках гарантии - то предложат гарантийную замену.. кто же от нее отказывается. А если проблема не гарантийная, то вам об этом тоже сообщат и предложат ремонт за деньги, от которого вы можете отказаться. Пометку конечно сделают, но она ни на что повлиять не может. Что за вариант в котором негарантийная проблема может повлиять на гаратнийную - не понятно.
Более того скажу. Мне на прошлом ТО мастер сообщил, что у меня есть проблемы по подвеске и предложил не гарантийный ремонт. Я ему не поверил, потому что никаких признаков проблем с подвеской не ощущал. Тем не менее какие то заметки он сделал на карте ТО. На недавнем ТО через 15тыщ мне сказали, что никаких проблем с подвеской у меня нет. И этому я совершенно не удивился=)